配额限制和入渔条件提高直接制约了远洋渔业成长空间：随着国际渔业资源的衰退和各国家对本国渔业资源的保护，远洋渔业企业在取得公海捕捞配额和获取相关国家入渔许可上的难度越来越大。目前，大部分渔业资源的捕捞配额已阶段性分配完毕，这直接限制了我国大洋性捕捞的产量。另外，沿海国家的入渔条件日益苛刻，除了高额的“入渔费”外，许多国家要求捕捞企业在当地投资渔业设施建设，极大的提高了过洋性捕捞的成本，打击了企业的积极性。
 
    远洋捕捞船只整体装备水平较低，发展后劲不足：我国远洋渔船多为国外购买的二手船或由近海捕捞船改装而成。船只老化严重，船龄在 20 年以上的占 40%左右。另外，捕捞和加工冷藏装备落后，导致渔获率低和保鲜能力差，将直接影响单位捕捞成本与产品销售。

    利润主要来自政府补贴，缺乏捕捞资源决定权与定价权使得盈利具有较高不确定性：我国远洋企业的利润大部分来自政府的燃料补贴和其他补贴。若不计算政府补贴，大部分远洋渔业企业处于微利甚至亏损的状态。企业的盈利状况完全取决于渔获量，渔业资源的变化将直接影响企业财务表现，盈利具有较高的不确定性。远洋渔业企业的竞争主要表现在对渔业资源和市场的竞争上。由于捕捞资源有限，有限的捕捞配额成为远洋渔业企业激烈争夺的对象。定价方面，同其他水产品一样，远洋捕捞企业只能被动接受市场博弈的最终价格，产品溢价较低。

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