多年生牧草大多数属于异花授粉的植物，授粉情况对种子产量和质量关系极大，生产上常采用人工辅助授粉提高牧草的授粉率，增加牧草种子的产量。
1 禾本科牧草的人工辅助授粉
　　禾本科牧草为风媒花植物，借助于风力传播花粉。对禾本科牧草进行人工辅助授粉，必须在大量开花期间及一日中大量开花的时间进行。禾本科牧草人工辅助授粉时用人工或机具于田地两侧，拉张一绳索或线网于牧草开花时从草丛上掠过。空摇农药喷粉器或小型直升飞机低空飞行都可使植株摇动，起到辅助授粉的功效。
2 豆科牧草的辅助授粉
　　大多数豆科牧草是自交不亲和的，所以生产种子所必须的异花授粉都要借助于昆虫。蜜蜂(Apis mellifera)、蝗蜂(Bombus spp)、碱蜂(Nomia melanderi)和切叶蜂(Megachile rotundata)等是豆科牧草的主要授粉者。切叶蜂或碱蜂对紫花苜蓿有性花柱的打开和传粉起着非常重要的作用，几乎每一次采花都能引起花的张开和异花授粉。蜜蜂对百脉根、蝗蜂对红三叶的授粉有特别效果。故在不同的牧草种子田中应配置相应的蜂类，一般每公顷配置3～10箱蜂用于传粉。