过去我国农业面源污染治理、市场准入条件、生产许可、质量抽查、进出口商检等来自多个部门。国家机构改革方案正式实施后，将新组建生态环境部、农业农村部、国家市场监督管理总局，肥料行业的监管体系将会发生哪些较大变化？
一方面，避免了肥料行业监管的政出多门，实现统一管理。比如改革前水肥一体化、农田土壤有机质提升、高标准农田建设等项目实施过程中涉及农业部、中央农村工作领导小组、财政部、国土资源部、水利部、国家发展和改革委员会等多个部门，而改革后新组建的农业农村部实现了在农业投资、农田整治、农田水利和农业综合开发方面进行统一管理的职责。
另一方面，提高了对肥料行业的执法和管理效率和效果。将国家质量监督检验检疫总局的出入境检验检疫管理职责和队伍划入海关总署，则使肥料进出口实现了“关检”合一，并使列入法检目录的有机肥料和部分化肥进出口手续将明显简化；农口肥料执法整合进入农业综合执法职能。由农业农村部指导、组建农业综合执法“国家队”，将农业系统内兽医兽药、生猪屠宰、种子、化肥、农药、农机、农产品质量等执法队伍整合，提高了执法效率和效果。